Hệ thống chiến đấu Hyperdimension Neptunia Re;Birth3 V Generation mang những đặc điểm của thể loại game nhập vai theo lượt, các nhân vật có thể di chuyển và tấn công trong một vùng nhất định vào mỗi lượt đi của mình. Các đòn tấn công của game được chia làm 3 loại chính: Rush – tấn công liên hoàn, Attack – gây sát thương lớn và Break – phá vỡ giáp của kẻ địch.
